Институт системного программирования им. В.П. Иванникова РАН


Изучение взаимодействия кофеина с ДНК в водном растворе методом Монте-Карло с использованием параллельных вычислений.

Авторы

Калугин М.Д., Теплухин А.В.

Аннотация

Методом Монте-Карло с использованием параллельных вычислений проведено моделирование водных растворов кофеина, содержащих сверхспиральный фрагмент В-ДНК. Установлены места связывания молекул кофеина с ДНК и наиболее вероятные структуры образующихся комплексов. Выполнена оценка степени ассоциированности молекул кофеина в водных растворах различной концентрации и выявлены основные типы конфигураций молекулярных агрегатов.

Ключевые слова

Вода, структура, кофеин, ДНК, компьютерное моделирование, Монте-Карло, параллельные вычисления

Издание

Журнал структурной химии. 2009. Т. 50. № 5. С. 878-889.

Научная группа

Компиляторные технологии

Все публикации за 2009 год Все публикации